QFan работает безотносительно к ОС на уровне электроники. Настройки записываются БИОСом при старте. Так что чтобы он заработал, надо просто включить соответствующую функцию в BIOS. А с C&Q сложнее -- там нужна программа, управляющая частотой процессора в зависимости от задачи, и должен быть собран (или загружен) соответствующий модуль ядра.