Немного поексперементировал и нашел, что винда не ставить миксер в режим mute, а полностью выключает звуковую карту. В линухе попытался сделать тоже самое (mute не помогло) и прописалл "alsactl power off" в halt скрипт, что работает просто замечательно.
Прозьба к вам: если у когонибуть есть схожая проблемма и желание ее решить, добавте пару коментов в ниже указанный баг. Мне одному не по силам бодаться с ядерщиками.