Я тут заметил одну вещь... что колёсико у мышки крутить приятней "вверх" (толкать), чем "вниз". А т.к. мы чаще листаем вниз, то предлогаю зделать так:
xorg.conf:
Option "ZAxisMapping" "5 4"
Попробуйте, вам понравится :]
p.s: вспоминаются времена когда играл в кваку с инвертом вертикаольной оси координат