Две версии PHP?

Легко, если в варианте CGI. Только нужно конфигурить отдельно для каждого vhostа или директории.

если виртхост есть, то можно.
Легко можно на одном хосте, но не одновременно:
Скомпили модуль для апача, и поправь httpd.conf, на предмет AddMudule php5.so (я уже не помню). Естественно собрать модуль надо в другую деректорию нежели предыдущая версия.