синхронизация по инету

man -k sync | grep file

rsync попробуйте

В некоторых случаях dropbox может быть предпочтительнее (или unison, если паранойя мучает, но там под оффтопиком ерунда какая-то с клиентом)

rsync over ssh

dropbox работает через консоль?

Его можно демоном запустить

да