исчезла память с хард драйва

Может, это чудо? :-)
Файлы-то никуда не пропали? Так это и не проблема.
Есть подозрение, что это disk analyzer что-то криво посчитал...
Не факт, конечно. Слишком уж лаконично вы описали, чтобы что-то сказать.

Возможный вариант: временные файлы.
Или: было открыто много файлов, они были удалены, но до закрытия место не освобождалось. После перезагрузки место освободилось.

Скорее всего, вы ошибаетесь. Если посмотреть на скриншот, то там видно (даж я увидел, хотя утыкаюсь носом), что число файлов и размеры там одинаковые.

подозреваю опухание ~/.xsession-errors

Запретил запись, посмотрим что будет.

df -h

покажите, затем

du -sh

так ты посмотрел бы, кто туда о(с)рёт

значит что-то большое создаётся _прямо_ в домашней папке :)

А в «папках» - оно всегда так. Пользуйся «мамками».

После запрета записи .xsession-errors пока память не пропадает.