могут. но маловероятно. если spec (и нижележащий configure) написаны профессионально (что характерно для больших кроссплатформенных пакетов), то при наличии современного окружения все перестраивается на ура. пробуйте короче. rpmbuild --rebuild. еще вариант - взять srpm из rawhide и перестроить его локально