чем отличаются date и hwclock???

Шли бы Вы лучше, молодой человек, маны почитали, вместо того, чтобы глупые вопросы задавать.

date по умолчанию показывает местное поясное время берет его из системы. hwclock показывает время из микросхемы таймера. cron работает по местному поясному времени. Это все очень упрощенно.

Чтобы на hardware часиках синхронизировать время с системным надо дать команду hwclock --systohc, а уж системное лучше синхронизировать с атомными часами (ntp). Кстати если, сервер то надо обязательно подводить железные часики, а то после перезагрузки может даже ntp не сработать, там есть предел времени на которое он по умолчанию может синхронизироваться.