Написать однострочный скрипт на bash, в котором сравниваются 2 файла

man comm

Попытался что-то выцепить оттуда по итогу написал вот это comm -13 <(sort -u sitelist1.txt) <(sort -u sitelist2.txt) Но все равно не работает, не удаляет из sitelist2 одинаковые значения, а просто выводит некоторые названия в терминале

Ну так ты man comm почитай. Он и не будет ничего удалять. Он может не выводить строки уникальные для 1 файл, для 2 файла или для их обоих, скомбинируй параметры и выведи результат в новый файл.

Иди в армию, там подскажут.

А чтобы в 1 файле пропали просто дубликаты которые содержать в обоих файлах, это как сделать?

uniq в помощь

dron@gnu:~$ cat b.txt 
123
456
789
978
645
321
369
258
147
741
852
963

dron@gnu:~$ cat a.txt 
123
456
@789
978
645
@321
369
258
@147
741
852
@963

dron@gnu:~$ 

dron@gnu:~$ comm -13 --nocheck-order b.txt a.txt
@789
@321
@147
@963

dron@gnu:~$

https://www.opennet.ru/man.shtml?topic=comm&category=1

Или как вариант - с grep:

$ grep -xvf b.txt a.txt
@789
@321
@147
@963

А чтобы именно в файле sitelist2 удалились дубликаты это как можно сделать не очень понимаю

sort sitelist2.txt | uniq

Тож норм