Вопрос по каталогам

Любые.
Это свободное ПО.
Тут не уместен вопрос «можно ли?».
Тут есть только «как?» и «зачем тебе это надо?».

Ты вправе монтировать любой диск в какую угодно директорию, а в неё еще несколько, всё по простой причине «потому что можешь».

Разве можно например отделить от корневого раздела тот же /bin или /etc?

По стандарту вроде можно символической ссылкой.
http://www.pathname.com/fhs/pub/fhs-2.3.html#REQUIREMENTS

Технически возможно.

Технически возможно, надо только пропатчить скрипты в initramfs, чтобы сразу монтировать /etc.

Теоретически может сработать опция x-initrd.mount в fstab, по крайней мере в современных системах.

теоретически - конечно!
практически могут возникнуть определенные проблемы из разряда «решаемых».

Понятно, всем спасибо за ответы.