да не, я тоже без опцию пробовал.. сам не пойму в чем фигня.. из-за этого deltup .bz2 архивов автоматом не работет, приохдится в distinfo вручную новый размер и хэш ставить.. bzip2 стандартный из FreeBSD 5.4
$ bzip2 -d thunderbird-1.0.6-source.tar.bz2
$ md5 thunderbird-1.0.6-source.tar
MD5 (thunderbird-1.0.6-source.tar) = 6826bd4f1a5267bdea1460e0ed0f19cb
$ bzip2 thunderbird-1.0.6-source.tar
$ md5 thunderbird-1.0.6-source.tar.bz2
MD5 (thunderbird-1.0.6-source.tar.bz2) = b9835f7584ba32b3d0095f4788f2c5db
$ bzip2 -d thunderbird-1.0.6-source.tar.bz2
$ md5 thunderbird-1.0.6-source.tar
MD5 (thunderbird-1.0.6-source.tar) = 6826bd4f1a5267bdea1460e0ed0f19cb
$ bzip2 -h
bzip2, a block-sorting file compressor. Version 1.0.2, 30-Dec-2001.
usage: bzip2 [flags and input files in any order]
.....
$
сорри, нечитаемо выше получилось
и в дагонку:
решил обновиться до bzip2-1.0.3 - он мне начал выдавать как и с -z9, так и без, тот же md5 как у тебя.
откатился назад на 1.0.2.
bzip2 без опций и с -z9 выдает архив с таким же md5sum как например тут: