Ys Origin видеоролики перевёрнутые.

Попробуй протон постарее.

Да пробовал 7 версии. Может попробовать ещё старее хД

Может proton-ge попробуешь?

Мысли в слух Игры нет чтобы что-то проверить.

В DirectX и OpenGL координаты текстур по оси Y зеркально разные, это просто данность. Разные API и разные спецификации.
Из одного в другое приводится явно, если нет переопределения явного, на любом из уровней, в игре, в proton, в mesa, в кешах.

Видимо есть такая-то конфигурация, скорее всего она в игре, где для роликов можно задавать правило, как их крутить, или она генерирует шейдер в котором есть конверсия, или proton генерирует шейдер в котором происходит конверсия координат. Это я к тому что, как бы глупо это не звучало, проверь кеш игры, и сбрось кеш шейдеров. Возможно при принудительном закрытии что-то записалось не так, и теперь оно игнориуется и используется дефолт вшитый.

В логах вывода игры или протона может есть что-то типа file corrupted ignore или типа того.

Его обычно использую. Но вчера поставил бету proton 10. И всё чудесным образом починилось. Хотелось бы всё же знать где именно оно так извратилось.