Как сейчас принято считать хеш-сумму для различения гиговых файлов между собой?

Битторент использует sha1 от каждого блока фиксированой длины.

Если интересует подробнее: http://www.bittorrent.org/beps/bep_0000.html . Всё предельно понятно.

вообще торренты используют md5

Оба, но в первую очередь sha1, как сказал анонимус. И считает md5 .торрент файла и md5 всего файла, который скачивается.