Сейчас начнется война миров. На самом деле нет разницы GTK или Qt, к чему привык, то и используй. Насчет стоит или нет - то это тоже вопрос привычки. Я лично, чисто ради интереса попробовал три варианта PyGTK, PyQt и wxPython и мне показалось, что нет никакой разницы на чем писать : на C++ с Qt и или Python c Qt, к примеру.