exit не завершает сценарий bash

твой «while read user1» интерпретируется другим shell интерпретатором нежели cat /etc/ppp/users.

Дальше решай проблему сам:)

Считай что твой «while read user1» это отдельная програмка

не совсем «отдельная програмка» - всё хуже :) Это множество «программок», запускаемых одна за другой столько раз, сколько крутится цикл.

Здесь можно через «for .. in» побаловаться, типа так:

for user in $(awk '$1!~/#/ {print $1}' /etc/ppp/users); do
[ «$vpnname» = «$user1» ] && {
$HOMEBILLING/firewall-rules.up
#sleep 20
exit 0
}
done

Можно вместо «exit 0» использовать, допустим «exit 55», а после «done» написать [ $? == 55 ] && exit 0.

Никакое это не множество программ. Запускается другой интерпретатор в новом потоке или в новом процессе в зависимости от реализации шелл интерпретатора и интерпретирует цикл while.