Как преостановить поток (pthreads)?

В этом случае, т.е. если тред приостанавливает сам себя, не сканает ли вызов sigwait()?

Можно попробовать его усыпить каким нибудь nanosleep(); Или вызовом poll(), не думаю что это безвыходная ситуация, и надо останавливать сигналом.