Java SE Framework

Хибернейт и спринг можно использовать как на EE, так и на SE. Как вместе, так и поотдельности.

то, что в спринге есть своя реализация бинфактори, еще не делает его контейнером - это кое-что другое

в спринге есть реализация IoC контейнера http://en.wikipedia.org/wiki/Spring_Framework#Inversion_of_Control_container

а так контейнеры они разные бывают, для мусора например. Это безусловно кое-что другое

Анонимус, не бредь. Чем я по-твоему занимаюсь последние полгода? На*бываю начальство что ли?

> Требуется написать клиент-серверное приложение на SE. Два клиента, один сервер, взаимодействуют по сети, и с СУБД. Есть ли какие-либо фреймворки для SE и стоит ли их использовать? По описанию, Spring можно использовать не только в ЕE. Так ли? Из вспомогательного пока думаю использовать только Hibernate.

Использовать можно много чего, нужно ли? Если сроки сжатые, советую не выпендриваться и юзать то, что знаете. Spring вам сроки точно не сократит. Hibernate скорее всего тоже, если только с базой не планируется работать очень много.

> Опыта разработки больших проектов мало. На что посмотреть?

Советую во-первых убедиться, что требования собраны правильно, меньше переписывать надо будет. Если не собраны — собрать. Во-вторых спроектировать вменяемую архитектуру. Паттерны, MVC и прочий баззвод. Эти баззводы сильнее чем Spring + Hibernate.