apply

fun.apply(thisArg, [argsArray])

http://devdocs.io/javascript/global_objects/function/apply

Потому-что глодиолус
setTimeout.apply(null, [function(){ alert(«Hello»); }, 3000]);

apply -> call

setTimeout.call(null, alert, 1000 , "Hello")

Мда надо доки было читать. Спс. )))

А зачем alert заворачивать в лямбду?

Я на call и делал сначала. Но нужно вот именно apply.

потому-что первый аргумент setTimeout может быть либо строкой - js-код который eval-нут, либо Function объект который вызовут без аргументов. т.е можно было и так setTimeout.apply(null, [«alert(\„Hello\“)», 3000]);
В конце концов попробуй сам, обожгись, потом почитай доку :)

Почему не работает?

Потому что не call.