В muse есть что-то чего нет в org-mode?

По моему, org-mode не так уж и давно начал развиваться в отличие от muse. Но за несколько лет развития, org-mode уже сейчас превратился в монстра. Продублировав множество уже существующих режимов в emacs. В частности, не так давно появилась возможность экспорта в кучу всяких форматов. Иначе, это не muse урезанная версия, это org-mode комбайн.

Урезанно - не в плохом смысле слова если софт не собирается быть комбайном.