Попробуй под рутом сохранить настройки (только не лазь на сомнительные сайты - изменил, сохранил, проверил). Может просто огнелис твой настройки пытается сохранить туда, где у тебя нет прав. И вообще, запусти его в xterm'е (или что там у тебя...) и посмотри, что он пишет.