>в чем может быть проблема
Ну, в том, что ваше сообщение совершенно не понятно.
>как ее решить
Написать, что вы делаете. Разрабатываете на флэше и перехватываете клавишу Ctrl? В каком-то чужом флэш-приложении не работает Ctrl, хотя должен?
>в других браузер почему то работает
Возможно, Опера настолько жестко перехватывает хоткеи.
Попробуйте сначала удалить из оперы вообще все горячие клавиши. Для этого создайте новый профиль горячих клавиш (Меню > Настройки > Расширенные > Управление), все из него удалите (потому что там новые профили создаются только копированием старых, ЕМНИП) и включите его. Посмотрите, что получится.
>еще есть варианты?
Боюсь нет. Даже погуглил, нагуглил две темы, так там тоже нет решения (кроме «не пользоваться для игры Оперой»). Вы их, наверное, уже читали, но на всякий случай: