Возможно ли запустить программу из-под пользователя X в иксах, запущенных под пользователем Y?

Можно. Есть даже скрипт, который сильно облегчает процесс. Называется "sux", описание и ссылка на исходник тут: http://fgouget.free.fr/sux/sux-readme.shtml

Ух ты... ;)

сенкс ;)

gksu, kdesudo

А просто su -c "some_gui" уже не работает?

#!/bin/sh

DISP=":0"
XUSER=`who | grep $DISP | awk '{ print $1 }'`
DISPLAY=$DISP su -c 'xmessage hello' $XUSER

--------------------------------------------------------

не забыть перед этим от пользователя Y разрешить доступ к иксам:

# xhost +LOCAL:LOCAL

Можно Х пускать с параметром "-ac" (disable access control restrictions)

Можно, но не нужно ;)