Ну рукописный - это несколько другое. Кстати, я имею в виду не столько текст, сколько ввод. В общем говоря, даже нечто подобное палмовскому граффити мне вполне подойдёт, а это вещь уже весьма простая. Конечно, если найдётся полноценная распознавалка текста - будет значительно лучше.
Кстати, на сайте paragon'а есть множество упоминаний, что они якобы портировали на линукс pen reader, но даже триал скачать нельзя. Типа, у нас есть распознавалка под линух, но мы её вам не покажем.
Не знаю как для десктопов, но в наладонных любительских средах на базе GNU/Linux (OPIE, GPE) распознавалка шикарная. В OPIE распознавалка работает лучше, чем Graffiti 2 в Palm OS на T|T3, плюс из коробки можно изменять росчерки под себя, плюс есть автодополнение из словарика. Вероятно, при должном количестве сноровки можно прикрутить эту систему к настольному Линуксу.