Добрый день. Установил mupdf. Там два бинарника mupdf-x11, mupdf-gl. Открываю pdf-ку с помощью mupdf-x11. В свойствах окна Class: mupdf, Resource: MuPDF. Используя это, установил иконку
Style mupdf EWMHMiniIconOverride, MiniIcon $[fvwm_icon]/mupdf.png
Style mupdf-gl EWMHMiniIconOverride, MiniIcon $[fvwm_icon]/mupdf.png