Возможно ли это стандартными средствами iptables? P-O-M connmark кажется это позволяет, но мне бы хотелось как-то переносимее.
Накой это нужно? :) Встроил в свой QoS скрипт возможность записи в лог информации о том, какой трафик в какой класс пошел. С портами и т.д. кажется работает, а вот с fwmark... :)

