Как лучше сделать?

Базы разные или они реплицированы между собой?

Для начала распиши, каким образом данные будут размазаны по двум базам данных. Случаев может быть много разных.

Если половина нужных таблиц в одной базе данных, а другая половина в другой, то тебе надо посоветоваться в Rails-разработчиком. ActiveRecord, DAO и QueryBuilder нормально настраиваются на любое количество баз данных.

Да половина таблиц в одной базе половина в другой.
Желательно сделать без дополнительных телодвижений в рельсах. В базы кроме моего веб приложения еще будут писать другие программы. Репликация подойдет для такого случая?

Тебе нужно отнаследовать от ActiveRecord::Base два класса, и в каждом указать параметры подключения к базе. Соответственно, от этих двух классов уже нужно наследовать реальные модели, данные для которых храняться в этих базах.

Довольно просто и нет никакой магии. Погугли multiple databases in rails.

Гугли Add second database Rails

А вообще там всё просто делается, просто одни модели будут в одной базе, другие в другой. Как работа с одной базой выглядеть не будет.

Да думаю то, что нужно. Всем спасибо, буду разбираться.

как-то так..

  $config = YAML.load_file(File.join(File.dirname(__FILE__), 'database.yml'))
  class Posts < ActiveRecord::Base
    establish_connection $config['onedb']
  end