iptables похоже не понимает строк длиннее определенного размера или уже поздно и я чего-то не понимаю

Вообще-то в правилах нужно указывать реальные ip, а не eeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee.com. Длина строки роли не играет.

дело в том, что eeeeeeeeeeeeeeeeee.com работает если я не указываю --dport xxxx, т.е. строка увеличивается в размере за счет порта

А ты не путаешь iptables с ipchains

А что в ipchains, было ограничение на длину строки?

Нет.