Стоит Samba 2.0.7, security = server (указаны PDC и BDC), encrypt passwords = yes, каждый пользователь, имеющий право обращаться к ресурсам заведен в passwd и shadow. Samba запускает для каждого пользователя, обращающегося к ресурсам, свой процесс. Почему для одних пользователей uid процесса равен uid'у пользователя, а остальных - root? Пользователи ничем друг от друга не отличаются.