сделал
# mysqldump -p zabbix >zabbix.dump
дамп ~2Gb создался минут за 5-10, в общем, не долго.
скопировал дамп на другой сервер и запустил
# mysql -p zabbix < zabbix.dump
заливается уже час с полной загрузкой HDD и минимальной загрузкой CPU. Грустно.
Как можно ускорить загрузку?