Как узнать, через какие порты входит/выходит информация?

Посмотри через iptraf

man tcpdump

Какие-то нестандартные решения предлагаются. Хотя, они вполне разумны, если не учитывать, что вопрос исходит от новичка. netstat -a. Эта утилита есть во всех юниксах.