samba xinetd

Проверьте, не запускается ли у вас samba как standalone ? Т.е. сначала сама по себе (без xinetd), а потом вы ее еще и через xinetd пытаетесь запустить, а т.к. порт уже занят, то она не может на него повеситься (bind failed).

А какой метод запуска лучше

Вам решать :-)
При standalone она будет висеть всегда, поэтому, если ею пользуются редко, лучше так не делать. Если через [x]inetd, то samba будет запускаться тогда, когда действительно нужно (когда пришел запрос), экономя при этом память. Если запросы приходят часто, то это постоянно будет ее дергать, поэтому в этом случае лучше запускать как standalone. Зато, если вдруг она слетит, при следующем обращении [x]inetd ее переподнимет, а при stand alone нужно об этом заботиться самому (скрипты писать, в inittab через respawn,...).