Посмотрел я .SPEC файл от SRPM , там вроде все ровно. Значит гдето в конфиге. Стал эксперементировать с SetEnv и PassEnv, переменные появляются но только в PHP Variables. В Apache Environment все также 5 фейковых переменных.
Кто знает причину по которой подменяет Apache переменные? И как ее разрешить?