Как запускать процессы с большим приоритетом ???

man nice.

Ничего не знаю про самбу (знаю только, что это такое), но сомневаюсь, что повышение приоритета поможет. Скорее всего дело не в том, что не хватает cpu, это можно проверить, глядя в /proc/loadavg во время закачки.

Трудно гадать на расстоянии, может быть масса причин, но рекомендую начать с hdparm - проверить/выставить dma флаг.

понял спасибо , кажется глюк в другом - смарите пост про проблему со скоростью диска .

Кстати ещё проверь (по поводу диска) ядро ,что бы оно скомпилированно было с поддержкой UDMA