Пробовал 2 версии ядра, родное и самосборное. Поискал в инете нашел что 960Мб это Low-memory в линуксе, только почему-то не нашел как в 64 битной версии подключить поддержку всей памяти, там минимум настроек по памяти, может надо смп и нуму включать?
Ларчик довольно просто открывался. На это влияла опция в биосе AGP aperture. Сейчас следующая картина CPU 0: aperture @ c0000000 size 512 MB Memory: 1028016k/1048512k available (2057k kernel code, 19728k reserved, 895k data, 200k init)