Apache и защита по паролю (.htpaccess) cgi-bin

Ты можешь ограничить доступ к той директории где у тебя эти скрипты живут
Как по паролю так и по ip адресам

Вот здесь сказано как это сделать с паролем
http://httpd.apache.org/docs/misc/FAQ.html#user-authentication

Удачи!