В дебиане можно сделать:
./configure && make && make install && checkinstall -D make install && dpkg -i foo_09090.deb
или
dh_make --createorig && dpkg-buildpackage -rfakeroot && dpkg --install foo_09090.deb
Всё очень легко и просто, а пакет потом легко можно удалить из системы. Есть ли скрипты/шаблоны для создания ебилдов генте? Потому что их официальный манул меня весьма не впечатлил, а устанавливать программы с /opt - это дебилизм.
Что делать, если требуется использовать cmake вместо ./configure (а уж тем более, если нужно нестандартные команды выполнить) - вообще непонятно.
Реквестирую megabaks'а в тред, т.к. он точно должен знать, раз свой оверлей имеет.