импортирую базу из дампа таблица 100 Мб импортируется без малого 2 часа, с чем связаны такие дикие тормоза? загрузка 2 процессоров ничтожно мала, памяти свободной много
Однозначно bottlenneck в disk IO. AFAIU innodb будет коммитить периодически если INSERT'ов много? Попробуй поставить innodb_flush_log_at_trx_commit = 0.
Много ли в таблице индексов? *может быть* поможет, если ты создашь MyISAM таблицу без индексов, зальешь туда, а потом сделаешь INSERT ... SELECT в InnoDB таблицу с индексами