Дык для sqlite пишешь в php.ini чтоли dlopen("sqlite.so") или что-то типо того (so сосешь с сайта sqlite) и имеешь функции. Правда надо рута на машине иметь. Для MySQL достаточно скомпилить php с соотв. опцией и тоже имеешь функции. Или я что-то неправильно понял?