Исправление UVV, 22.07.15 11:15 (текущая версия) :
Projects -> Build & Run -> Build Steps -> Add Build Step -> Custom Process Step и там твой скрипт заливает бинарник на плату
Исходная версия UVV, 22.07.15 11:15:
Projects -> Build & Run -> Build Steps -> Add Build Step -> Custom Process Step