История изменений
Исправление slovazap, (текущая версия) :
С одной стороны, не понятно при чём тут эти .bat файлы, с другой - не приведено содержимое cmake/Doxygen.cmake и doxygen/CMakeLists.txt которые скорее всего как раз «при чём».
Вангую, что либо в Doxygen.cmake, либо в doxygen/CMakeLists.txt у вас есть директива add_custom_target(doc ...) которая запускает doxygen, и у неё есть параметр ALL, благодаря которому эта цель помимо `make doc' запускается и при просто `make'. Тогда вам надо просто убрать этот ALL.
Исходная версия slovazap, :
С одной стороны, не понятно при чём тут эти .bat файлы, с другой - не приведено содержимое cmake/Doxygen.cmake который скорее всего как раз «при чём».
Вангую, что в Doxygen.cmake у вас есть директива add_custom_target(doc ...) которая запускает doxygen, и у неё есть параметр ALL, благодаря которому эта цель помимо `make doc' запускается и при просто `make'. Тогда вам надо просто убрать этот ALL.