хм, обычно в вайне наоборот окно теряет фокус. Но у меня и такое случалось на hyprland. Я могу шорткатами просто отправить окно на другой воркспейс и в зависимости он настроек (не следовать туда за окном) оно теряет фокус. Не знаю насколько в гноме это поможет