MySQL литл проблем

Возможно дело в том что в my.cnf прописаны пути для пространства InnoDB теперь недоступные для mysqld... Проверь my.cnf. Если так все оставиш то тебе не будет доступен тип InnoDB для таблиц.

Этожеж вроде обсуждалось уже неоднократно.
/tmp/.private - работа pam_mktemp.
mysql_safe стартует из под рута, таким образом tmpdir = /tmp/.private/root, затем он понижает привелегии до пользователя mysql и он уже ничего с .private/root сделать не может.
# lsattr -d /tmp/.private/
Если особо не заморачиваться выход такой:
В инит скрипте mysql (/etc/init.d/mysql) меняем нечито вроде
$bindir/mysqld_safe --datadir=$da...
на
env TMP=/tmp TMPDIR=/tmp $bindir/mysqld_safe --datadir=$da...

я чуток запутался :( вот скрипт, где и что поменять?

#!/bin/bash
# mysqld	This shell script takes care of starting and stopping
#		the MySQL subsystem (mysqld).
# chkconfig: - 78 12
# description:	MySQL database server.
# processname: mysqld
# config: /etc/my.cnf
# pidfile: /var/run/mysqld/mysqld.pid
# Source function library.
. /etc/rc.d/init.d/functions
# Source networking configuration.
. /etc/sysconfig/network
prog="MySQL"
datadir="/var/lib/mysql"
start(){
	touch /var/log/mysqld.log
	chown mysql.mysql /var/log/mysqld.log 
	chmod 0640 /var/log/mysqld.log
	if [ ! -d $datadir/mysql ] ; then
	    action $"Initializing MySQL database: " /usr/bin/mysql_install_db
	    ret=$?
	    chown -R mysql.mysql $datadir
	    if [ $ret -ne 0 ] ; then
	    	return $ret
	    fi
	fi
	chown -R mysql.mysql $datadir
	chmod 0755 $datadir
	/usr/bin/safe_mysqld  --defaults-file=/etc/my.cnf >/dev/null 2>&1 &
	ret=$?
        # Spin for a maximum of ten seconds waiting for the server to come up
	if [ $ret -eq 0 ]; then
            for x in 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10; do
            if [ -n "`/usr/bin/mysqladmin ping 2> /dev/null`" ]; then
                    break;
            else
                    sleep 1;
            fi
            done
            if !([ -n "`/usr/bin/mysqladmin ping 2> /dev/null`" ]); then
                    echo "Timeout error occurred trying to start MySQL Daemon."
                    action $"Starting $prog: " /bin/false
            else
                    action $"Starting $prog: " /bin/true
            fi
	else
    	    action $"Starting $prog: " /bin/false
	fi
	[ $ret -eq 0 ] && touch /var/lock/subsys/mysqld
	return $ret
}
stop(){
        /bin/kill `cat /var/run/mysqld/mysqld.pid  2> /dev/null ` > /dev/null 2>&1
	ret=$?
	if [ $ret -eq 0 ]; then
	    action $"Stopping $prog: " /bin/true
	else
    	    action $"Stopping $prog: " /bin/false
	fi
	[ $ret -eq 0 ] && rm -f /var/lock/subsys/mysqld
	[ $ret -eq 0 ] && rm -f $datadir/mysql.sock
	return $ret
}
restart(){
    stop
    start
}
condrestart(){
    [ -e /var/lock/subsys/mysqld ] && restart || :
}
# See how we were called.
case "$1" in
  start)
    start
    ;;
  stop)
    stop
    ;;
  status)
    status mysqld
    ;;
  restart)
    restart
    ;;
  condrestart)
    condrestart
    ;;
  *)
    echo $"Usage: $0 {start|stop|status|condrestart|restart}"
    exit 1
esac
exit $?