Исправление CeMKa, (текущая версия) :
На микротике делал подобное, в линуксе думаю будет примерно похоже. Чтоб прозрачно отрабатывал прокси «в стороне», нужно чтоб у клиентов в качестве шлюза был прописан адрес прокси сервера, либо в случае при использовании роутера в качестве шлюза на роутере нужна ещё одна таблица роутинга где дефолт гейтом указан адрес прокси, и клиентов сети отправлять на гейт в этой таблице.
Исходная версия CeMKa, :
Чтоб прозрачно отрабатывал прокси «в стороне», нужно чтоб у клиентов в качестве шлюза был прописан адрес прокси сервера, либо в случае при использовании роутера в качестве шлюза на роутере нужна ещё одна таблица роутинга где дефолт гейтом указан адрес прокси, и клиентов сети отправлять на гейт в этой таблице.