Исправление Stanson, (текущая версия) :
Ну /etc/fstab -то одинаковый наверно, как и большая часть /etc. Тебе фактически в самом начале надо смонтировать только соответствующие дистру оверлеи поверх основной ФС. А дальше - уже загружайся соответственно инфе из основного /etc поверх которого уже смонтирован оверлей с соответствующими конфигами.
Исходная версия Stanson, :
Ну /etc/fstab -то одинаковый наверно, а оверлеи монтируй из скрипта.