LINUX.ORG.RU

Выбрать n случайных строк из большого файла

 


2

1

Есть текстовый файл, который содержит 100 миллионов строк, например.

Как быстрее всего выбрать из него 1000 случайных строк (желательно башем или стандартными утилитами, но не perl/python)?

Заранее спасибо.

★★☆☆

Ответ на: комментарий от Eddy_Em
...
#include <time.h>
...
int main(int argc, char **argv){
        srand48( time(NULL) ) ;
...
}

А вот не за что получать-то. Забыл инициализировать генератор случайных чисел.

The lcong48(), seed48(), and srand48() functions are initialization functions. You should invoke one of these before calling either the drand48(), lrand48(), or mrand48() function.

http://publib.boulder.ibm.com/infocenter/zvm/v6r1/index.jsp?topic=/com.ibm.zv...

kostik87 ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от kostik87

А вот не за что получать-то. Забыл инициализировать генератор случайных чисел.

Какая мне разница, если на выходе получаются разные строки?

xtraeft ★★☆☆
() автор топика
Ответ на: комментарий от xtraeft

Какая мне разница, если на выходе получаются разные строки?

У меня не получаются разные строки:

$ ./main l 10 && date
2
318176
200249
468708
25623
439300
251842
374640
399528
483800
Вт. окт. 28 20:45:29 MSK 2014
$ ./main l 10 && date
2
318176
200249
468708
25623
439300
251842
374640
399528
483800
Вт. окт. 28 20:45:31 MSK 2014
$ ./main l 10 && date
2
318176
200249
468708
25623
439300
251842
374640
399528
483800
Вт. окт. 28 20:45:32 MSK 2014
Как видите три вызова и выводы одинаковые. Система 32 битная. Если инициализировать генератор, то всё работает корректно. В любом случае генератор должен быть инициализирован. Так что лучше внесите правки и скомпилируйте заново исходник.

kostik87 ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от xtraeft

Плевать на красоту кода

да. другое дело maintanability и security

anonymous
()
Ответ на: комментарий от kostik87

О чём же?

Об уникальности строк в пределах одного выхлопа.

xtraeft ★★☆☆
() автор топика
Ответ на: комментарий от anonymous

Дык академики, как правило, и используют сишку. На лиспах пишут мамкины борщевики же.

pedobear
()
Ответ на: комментарий от xtraeft

Там в шапке написано как компилять. -lm добавь. Ну или можно вообще, как выше предлагали, выкинуть dtime и сделать

	if(fail){
		r_ini = (long)(time(NULL));
	}

А в шапку еще добавить #include <time.h>, тогда не надо будет #include <math.h> и -lm.

А вообще, если это только в линуксе будет работать, вариант на случай невозможности открывания или чтения /dev/random можно выкинуть — маловероятно, чтобы в линуксах его не было.

Eddy_Em ☆☆☆☆☆
()
Последнее исправление: Eddy_Em (всего исправлений: 1)
Ответ на: комментарий от anonymous

Претензии — в студию!

И что-то программисты как-то не спешат свой вариант объявить.

Eddy_Em ☆☆☆☆☆
()

Как быстрее всего выбрать из него 1000 случайных строк

я думаю быстрее всего будет:

1. создать массив из 1000 случайных чисел

2. отсортировать его (либо создавать уже сортированный, не имеет значения, т.к. цена этой операции невелика)

3. из массива сделать sed скрипт вида

#!/bin/sed -nf
234p
345p
2322p
5453p
…
94834p
это не долго, т.к. всего 1000 строк

4. скормить скрипту большой файл.

emulek
()
Ответ на: комментарий от derlafff

что shuf линейный, то бишь О(n)

у тебя тут n порядка 100`000.А можно добится времени 0(ноль), т.к. sed будет обрабатывать файл быстрее, чем он читается и одновременно с этим. А у тебя 100000 строк загонится в память, потом произойдёт перестановка(за O(N)), а потом уже 1000 первых строк результата выведется. Это слишком сложный способ, если ты знаешь, сколько в файле строк и число выходных строк небольшое. Быстрее заранее сгенерировать номера нужных строк, а потом читать большой файл, и только выводить нужные строки.

emulek
()
Ответ на: комментарий от gh0stwizard

open -> seek (X1)

как ты предлагаешь делать seek, если все строки разные? Ну скажи мне позицию начала строки №100?

emulek
()
Ответ на: комментарий от YAR

sed молотит данные у меня на скорости 33 МБ/сек, head/tail - 25-27. Зато mawk - на 70.

sed молотит даже немножко быстрее mawk, потому что записи в sed всегда оканчиваются \n. Ты просто включи LC_ALL=C, и регулярки не юзай.

emulek
()
Ответ на: комментарий от Eddy_Em

Делаем случайный lseek

так не честно. А если в начале файла все строки длинные, а в конце — короткие? Тогда оно будет выбирать начальные строки намного чаще, чем конечные.

Да и вообще вероятность выпадения строки у тебя зависит от длинны. Строка «ААААААААААААААААААААААААААААААААА» будет выпадать в десятки раз чаще, чем «А». Такого в условии не было.

emulek
()
Ответ на: комментарий от xtraeft

там, кстати, можно обойтись простой dd, читать случайный блок размером в 4К (для ext4), и в нём искать строчки. Т.е. сишка тут не нужна.

emulek
()
Ответ на: комментарий от emulek

А если в начале файла все строки длинные, а в конце — короткие?

Тогда у нас будет не равномерное распределение, а кривое. Но похрен. Все равно случайное.

Для того, чтобы честно выполнить эту задачу, придется сначала сделать индексный файл. А потом тупо из него брать случайные индексы и получать нужные строки. Скорость будет выше, чем в последней реализации. Но нужна будет подготовительная работа. А еще, если целевой файл быстро меняется, этот способ будет очень медленным (т.к. перед каждым запуском нужно будет сделать сканирование).

Собственно, так у меня псевдо-БД и работают.

Eddy_Em ☆☆☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от xtraeft

Ого, это на виртуалке с 1Гб памяти и ssd

кстати сразу предупреждать надо, на HDD это простое решение будет ЖУТКО тормозить.

если никто не побьет твой результат (кроме сишников).

а куда его побить-то? Тут уже в SSD упёрлось.

emulek
()
Ответ на: комментарий от YAR
du testfile5 | cut -f1

Можно без пайпа, но нужен stat(1):

stat -c %s testfile5

KennyMinigun ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от Eddy_Em

Тогда у нас будет не равномерное распределение, а кривое. Но похрен. Все равно случайное.

да? Ты только в азартные игры не играй, а то тебе голову проломят. Кроме шуток.

Для того, чтобы честно выполнить эту задачу, придется сначала сделать индексный файл. А потом тупо из него брать случайные индексы и получать нужные строки. Скорость будет выше, чем в последней реализации.

я это и предлагал чуть выше.

Но нужна будет подготовительная работа.

безусловно.

А еще, если целевой файл быстро меняется, этот способ будет очень медленным (т.к. перед каждым запуском нужно будет сделать сканирование).

и каким таким образом «целевой файл на 100500 строк» будет _быстро_ меняться? Только append, но для append нужно просканировать только новый хвост. А то я сомневаюсь, что можно быстро поменять _текстовый_ файл такой длинны.

emulek
()
Ответ на: комментарий от emulek

и каким таким образом «целевой файл на 100500 строк» будет _быстро_ меняться?

Логи прокси, например. А чтобы жить было веселей, логи делаем поминутные и сливаем их воедино скриптиком. Логи старше суток удаляем.

Вот тебе и шустро меняющийся мегадохренищаместазанимающий файл.

P.S. Давно уже пора нормальную ФС замутить, в которой можно будет у файла откусывать кусок начала. А то до сих пор костыли городить приходится...

Eddy_Em ☆☆☆☆☆
()
Последнее исправление: Eddy_Em (всего исправлений: 1)
Ответ на: комментарий от anonymous

Кстати, почему никто не замечает эту ссылку? Вроде, алгоритм точно ложится на ОП пожелание.

anonymous
()
Ответ на: комментарий от Eddy_Em

Блин. Поражаюсь! Ведь все ФС по сути могли бы поддерживать эту элементарщину: выкинуть из файла ненужный кусок, не переписывая файл заново. И нихрена не поддерживают.

Почему???

Как вообще такое может быть? Ведь это — самое логичное, что приходит в голову, когда вспоминаешь про логи!

Зачем разбивать логи на толпу файлов, если можно вести один-единственный файл, у которого будет кроном начало обрезаться? Или просто файл будет всегда иметь фиксированный размер (добавили блок в конец — удалили блок из начала).

Чертовщина какая-то...

Eddy_Em ☆☆☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от Eddy_Em

Логи

append

алгоритм тривиальный:

1. сканим весь файл, и запоминаем длину L0

2. получаем новую длину L1

3. сканим хвост длинной L1-L0

4. goto 2

Логи старше суток удаляем.

это тебе придётся ВЕСЬ файл переписать, если ты каждую минуту удаляешь строчки старше 24х часов. SSD такое издевательство пару недель выдержит и сдохнет. Не дольше.

Впрочем, HDD тоже побьёшь нафиг с таким режимом.

emulek
()
Ответ на: комментарий от Eddy_Em

Блин. Поражаюсь! Ведь все ФС по сути могли бы поддерживать эту элементарщину: выкинуть из файла ненужный кусок, не переписывая файл заново. И нихрена не поддерживают.

поддерживают, если ты туда нули пишешь. Тогда блок на HDD не хранится. Да, я понимаю, не совсем то, что ты хочешь.

Но то, что ты хочешь, на практике не нужно.

За то частенько нужно вот что:

1. Создаёшь файл размером 100500

2. потихоньку его рандомно заполняешь. Например торрент выкачиваешь.

Такое ФС умеют, если конечно ты догадался сделать файл из /dev/zero.

Зачем разбивать логи на толпу файлов, если можно вести один-единственный файл, у которого будет кроном начало обрезаться? Или просто файл будет всегда иметь фиксированный размер (добавили блок в конец — удалили блок из начала).

потому что логи лучше вообще удалить, и хранить только сжатую копию старого лога. Логи очень хорошо жмутся. Потому твоё предложение не нужно. Зачем хранить лог в 100Мб, если можно хранить текущий хвост в 10Мб, и ещё старые 90Мб в виде 9и мегабайтного сжатого файла? Учти, что процессоры сейчас быстрые, да и сжатие логов можно сделать nice -19, что-бы не мешалось.

emulek
()
Ответ на: комментарий от emulek

Я же сказал, задача для тех, кто дружит с си :) Допустим, что все строки гораздо меньше 4к. Следовательно, за один read можно получить 5-100 строк. Ну, дитя, сделай рандом ещё раз :)

p.s. Были бы индексы, то задача была иной.

gh0stwizard ★★★★★
()
Последнее исправление: gh0stwizard (всего исправлений: 1)
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.