Все таки появляющиеся тормоза при перемещении и подвисания компа меня в конец достали и я решил сменить оконный менеджер. Был выбран metacity.
Заходим в сессию Ubuntu Classic (No effects)
Без теней выглядит немного чопорно. Запускаем gconf-editor, идем в apps => metacity => generel и ставим галочку напротив compositing_manager.
Анимация сворачивания выглядит уродливо, поэтому отключаем и ее. Идем в desktop => gnome => interface и снимаем галочку с enable_animations.
Все. Теперь все очень быстро и стабильно работает. Мне не хватает только пожалуй плагина Grid.