В Ubuntu, или, возможно, вернее в Unity, имеется многолетний баг. Хотелось бы от него избавится.
Воспроизведение
0. Закрываем все окна nautilus
1. Открываем nautilus
2. Переходим на флешку или внешний жесткий диск
3. Переключаемся на другое окно
4. Кликаем по значку nautilus
В итоге вместо того чтобы открыть уже открытое окно - открывается новое