дорогой автор, у вас этот самый xterm, который на root window размазан, под windowmaker-овские иконки заежает? если да, то интересно, как вы текст под ними набираете? или просто обходите эти места ? тогда ваш код всегда должен иметь ваш уникальный отпечаток окна, типа screenshot fingerprint... :)