При следующем обновлении вас может ожидать вот это:
# rm -r /var/www/icons
# rmdir /var/www/conf/{modules,modules.sample}
# rmdir /var/www/users
# rm /var/www/cgi-bin/{printenv,test-cgi}
# rm /var/www/conf/{httpd.conf,magic,mime.types}
# rm /var/www/htdocs/{apache_pb.gif,blowfish.jpg,bsd_small.gif,index.html}
# rm /var/www/htdocs/{lock.gif,logo23.jpg,logo24.jpg,mod_ssl_sb.gif}
# rm /var/www/htdocs/{openbsd_pb.gif,openbsdpower.gif,openssl_ics.gif}
# rm /var/www/htdocs/smalltitle.gif
