объёмный график на питоне

Matplotlib такого, судя по всему не может.

Может, но лучше не надо, ибо медленно чтоппц.

Что посоветуете?

https://www.pyqtgraph.org/

paraview/vtk, mathGL… много их таких. Размеры небольшие так что скорость некритична, надо выбирать с т.з. удобства

У ТС в любом случае время получения результатов много больше времени отрисовки

Это верно, но если ему захочется этот график повертеть мышкой в интерактиве, то на слабом железе может быть больно.

Можете пример привести? Воксели из галерии матплотлиба совсем не то.

Эмм, а что надо-то, если не воксели? 3D-scatterplot?

И как задать чтоб цвет и прозрачность вокселя менялась в зависимости от значения в точке?

Тут уже давались советы. AntonI уже написал про paraview/vtk. Могу только добавит ещё про mayavi: https://docs.enthought.com/mayavi/mayavi/

Если Вы питоните, то будет самое то.

цвет веселее а прозрачность меньше

С «веселее» поосторожнее, пожалуйста. Анекдот про ситец помните? Как бы оно того, не обсмеяться в итоге.

Да ещё чтоб его рисовать можно было постепенно

Funcanimation вроде как.

Посмотрел я пока всяко-разное. Самое беспроблемное, что работает на питоне-3.9 и сразу установилось в анаконде - pyqtgraph. Но объёмные графики там боль и печаль. Так или иначе мне придётся самому рассчитывать цвет каждой точки. Варианты на vtk либо требуют питона не больше 3.7 либо не ставятся просто так в анаконду.

Я пока плюнул на эту визуализацию, через пол-годика вернусь к теме.

Такие пакеты как Paraview и Visit, которые предназначены специально для визуализации всякой объемной и трехмерной херни, имеют питоновские интерфейсы. Но это придется еще и их ставить и в них разбираться.

Пример похожего графика из гугла можно?

А мне говорили «зачем тебе этот матлаб, питон всё может»

https://commons.m.wikimedia.org/wiki/File:Arabidopsis_hypocotyl_viewed_with_confocal_microscope_(1).gif

Надо чтобы и покрутить можно было?

https://stackoverflow.com/questions/38364435/python-matplotlib-make-3d-plot-i...

Упрости до 2х мерной проекции (набор проекций на много панелей). Объёмные графики это попоболь. Там есть всякие пакеты, но их только локально можно использовать, удалённо практически невозможно.

Ты читал стартовый пост, дорогой? На картинке по ссылке каждая точка отображает интенсивность сигнала (x,y,z,I). По ссылке предлагают рисовать поверхности (x,y,z)

Тормозит и некрасиво.